Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms