Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms