Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC6Q9UBN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms