Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CC2D2AQ9P2K1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CC2D2AQ9P2K1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms