Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms