Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms