Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDND1Q9NY35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDND1Q9NY35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms