Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL11Q9NVR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms