Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms