Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG3Q9NT62 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms