Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD2Q9NRG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD2Q9NRG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms