Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUOX1Q9NRD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms