Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms