Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEPEQ9NQ76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms