Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms