Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRDQ9H2X0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms