Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC22A4Q9H015 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC22A4Q9H015 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms