Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2OQ9C0C9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms