Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
AMBRA1Q9C0C7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms