Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms