Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PCGF6Q9BYE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms