Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms