Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFAF3Q9BU61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms