Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms