Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRQ99707 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRQ99707 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRQ99707 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRQ99707 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRQ99707 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRQ99707 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRQ99707 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRQ99707 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRQ99707 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRQ99707 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRQ99707 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTRQ99707 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRQ99707 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRQ99707 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRQ99707 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRQ99707 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRQ99707 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRQ99707 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTRQ99707 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms