Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDCA3Q99618 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms