Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELF4Q99607 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELF4Q99607 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ELF4Q99607 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF4Q99607 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms