Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EYA3Q99504 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EYA3Q99504 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
EYA3Q99504 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EYA3Q99504 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms