Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms