Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WRNIP1Q96S55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms