Protein–RNA interactions for Protein: Q96PB1

CASD1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASD1Q96PB1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASD1Q96PB1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASD1Q96PB1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms