Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms