Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JSRP1Q96MG2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms