Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC7Q96M83 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms