Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TPD52L3Q96J77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms