Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms