Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL4Q96C24 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL4Q96C24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYTL4Q96C24 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYTL4Q96C24 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms