Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP1MTQ969P6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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