Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX13Q92968 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX13Q92968 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms