Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRQ92834 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRQ92834 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms