Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms