Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM41Q8WV44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRIM41Q8WV44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TRIM41Q8WV44 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms