Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMQ8TF30 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms