Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms