Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FSIP1Q8NA03 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms