Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SVBPQ8N300 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms