Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D3Q8IZS8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms