Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT1Q8IXI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms