Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APLFQ8IW19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APLFQ8IW19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms