Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNL1Q8IU54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms